深圳保稅區換包裝-保稅倉庫（保稅存放進口貨物）和出口監管倉庫（保稅存放待出口貨物）是保稅物流的基本形態和載體，特殊區域與這兩者相比，主要是整合、集成、拓展了“保稅倉庫”和“出口監管倉庫”功能，即貨物從境外進入中心內實行保稅，從境內進入中心享受出口退稅，在中心內還能開展如保稅倉儲、簡單加工和增值服務、國際物流配送、進出口貿易、國際中轉和轉口貿易、物流信息處理等多項業務，海關還賦予保稅倉庫一定的口岸功能。
當貿易商與生產商遇到產品出口了，卻因為包裝或產品質量需要退運的問題時。便可退運貨物到保稅區，進行包裝更換。
利用保稅區境內關外特殊政策，代替香港作為中轉站，可極大程度的降低運輸、倉儲、人工成本。貨物退運到保稅區無需辦理復雜的退運申請手續、無需做中檢證明、無需交保證金。 只需要提供貨物的裝箱清單，貨物價格明細以及原出口報關單即可。國內貿易商采購貨物進入保稅區包裝，簡單加工，分揀等； 國際進口貨物暫存保稅倉進行分包裝，分撥進口國內或者出口國外。