深圳保稅倉庫在進出口貿易過程中發揮著重要作用，比如關稅豁免、保稅流通、全球采購與配送等，特別是跨境電商的大發展，深圳保稅倉庫成為剛需，選擇什么樣的深圳保稅倉庫合作，甚至成為商家戰略層面要解決的問題，究竟該如何選？
一、查驗企業資質
深圳保稅倉庫需要經過一系列審批才能運營，比如在深圳市保稅區的保稅倉庫，需要經過深圳市保稅區管理局批準成立,并在工商部門及深圳海關注冊備案，甚至有些保稅物流園是經國務院批準設立的。在選擇深圳保稅倉庫前需要對審批和注冊資料都審核清楚，確保是信得過的深圳保稅倉庫，避免在日后的合作里因為倉庫資質問題受到不必要的影響。
二、考察監管專業度
深圳保稅倉庫會涉及到進口保稅儲存，出口復進口，國、洋貨集拼、流通加工、運輸配送等一系列的業務，保稅儲存是核心業務之一，這里提到的考察監管專業度，較淺層是指貨物在儲存過程中的安全性，比如倉儲庫攝像頭應該做到全面覆蓋，按照倉儲能力賠備充足的專業人員進行看管。
三、計算運輸成本
考慮預算不能只看深圳保稅倉庫花多少錢，更要計算貨物的運輸成本。具備保稅流通加工的深圳保稅倉庫可以省下一個環節的運輸成本，高效解決換箱、貼標識、分箱等問題。在多區域都設有倉庫的深圳保稅倉庫運輸上更靈活，所以應該納入參考體系。
查驗深圳保稅倉庫的資質是篩選合作商的第一步，確認之后進行實地考察，對監管專業度做評估，這兩點是通用標準，資質過硬的更好，監管做的越專業越好。在計算運輸成本環節，需要具體問題具體分析，需要細致的解合自身業務流程再做評估。